《异端的权利》讲述的是欧洲大陆在灿烂黎明之后重新沦为黑夜时的一个小故事。宗教改革英雄加尔文此时已经是日内瓦君临一切的最高统治者和暴君。而温和的充满人道主义气质的学者卡斯特利奥，以“苍蝇战大象”式的勇气，对加尔文的倒行逆施展开了英勇的对抗。

《异端的权利》揭示了一段历史的真相：

当作为异见者的新教徒企图获得自己应有的地位时，他们遭到了罗马教廷的无情迫害；而当作为新教运动代表人物的加尔文控制了一座城市之后，他在迫害异见者方面显得更为果决而残酷。这就产生了一个“苍蝇与大象之间的战争”的故事，一部“为失败的事业而战斗”者的泣血传记。

当整个时代沉沦于歇斯底里的无边黑暗之际，卡斯特里奥，一个坚持拥有独立信仰的小人物，无惧无畏，挺身直面“日内瓦新教皇”加尔文的残暴拭摧残。

尽管最终在贫病交加中寂寞地死去，但是，他的精神勇气，他的宽容气质，使他的名字在人类历史上璀璨夺目。

思想挽救了个人的渺小，蒲苇般脆弱的生命因此获得了存在的尊严。

在这场“权威”与“异端”的较量里，我们清晰地看到了人类历史一次次重演疯狂与屠杀的根源…